納稅人取得高新資格后，應當在3年有效期內，定期對知識產權的取得、研發項目的數量及質量、高新收入占比、研發費用投入占比、科技人員占比等高企認定指標展開關聯的、持續的、全面的評估。本案中，涉案企業就自查發現的享受非應享稅收優惠予以申報補繳，阻斷了稅務違法責任追究。具體而言，高新技術企業開展自查應關注以下要點：

（一）是否按照相關規定進行企業更名、發生與認定條件有關的重大變化是否及時向認定機構報告，是否及時填報年度發展情況報表

根據《高新技術企業認定管理辦法》第17條，高新技術企業發生更名或與認定條件有關的重大變化（如分立、合并、重組以及經營業務發生變化等）應在三個月內向認定機構報告。企業更名的，應及時取得重新核發的認定證書。并由專人負責高新技術企業資質的維護工作，包括但不限于在高新認定管理工作網填報年報、協調統計、稅局等部門有關高新信息的填寫審核，保證各部門報送數據除統計口徑差異外的一致性。

（二）知識產權申報數量、相關性、對產品的核心支持作用等是否符合認定條件

企業應就知識產權申報數量是否符合要求、知識產權是否與主營業務相關及其對產品的支持作用展開自查。為應對地區對知識產權存在申報時間與取得時間限制等情形，企業應摸索政策調整方向，并以此為依據在以后年度更加注重知識產權取得的連續性。

（三）從事研發和技術創新活動的科技人員占比是否符合比例要求

企業應對照勞動合同、社保繳納、個稅申報明細等材料，排查研發人員真實性。研發人員真實性將直接影響相應人員費用能否歸入研發費用，進而影響研發費用占比，可能導致企業因占比低于認定條件而被取消資格。

（四）各年度研發費用占同期銷售收入比例是否符合認定條件

研發費用歸集既牽涉高新技術企業申請審查認定通過與否，也將影響適用研發費用加計扣除稅收優惠是否合規。為了能夠準確核查企業各科目研發費用投入情況，企業應按研發項目或科目歸集研發費用。具體而言：

1.通過比對工資表、個稅申報明細、勞動合同崗位信息，確認其能否相互匹配印證，以工時為標準，對領導崗位和非全職研發人員工資做分配，確保研發人員真實性；

2.參考領料單等憑證確認材料費應歸屬于研發費用的真實性；

3.結合折舊明細表、固定資產發票，判斷設備是否用于研發，再進一步考察研發活動是否與研發人員使用相匹配，確保折舊費用發生的真實性；

4.立足與企業合同關于設計項目規定的權利義務，企業應綜合相關成果報告、測試記錄、勘察報告等反饋憑證，核查設計費用發生的真實性；

（五）高新收入的“高新”性及占比是否達標

根據《高新技術企業認定管理辦法》的規定，高新技術產品（服務）收入占企業同期總收入的比例不低于60%。企業可以就高新服務收入合同向技術市場予以備案，獲得第三方認可；或就工程項目中用到的高新技術結合工程項目形成文字說明，以應對高新檢查。